糸状菌はいわゆる「カビ」と呼ばれているもので、植物の病害の8割以上が糸状菌の被害といわれています。風や雨で飛ばされた胞子が植物体の表面に付着し、菌糸を伸ばして養分を吸収し、新たな胞子を作る、といった具合に広がっていきます。被害を受けた箇所は、変色や変形、腐敗などの症状が現れます。

糸状菌よりも小さい単細胞の生物で、糸状菌のように菌糸や胞子を形成しません。植物へは直接表皮を突き破ることはなく、主に傷口や気孔などの自然開口部から侵入します。水中を泳いで移動するため、雨や水やり、水滴の泥はね等が伝染の原因になります。

細胞を持たないため、生物学上は生物として扱われていない構造体です。電子顕微鏡を使わないと確認できないほど、大きさは非常に微小です。自力で伝染することはなく、アブラムシやウンカなどの吸汁性害虫や土壌微生物などが媒介して伝染しますが、ＴＭＶ（タバコモザイクウイルス）など少数のものは人の手指や農具による傷から侵入、発病します。ウイルスは一度感染すると薬剤で防除することができないため、伝染源となる病植物と、伝搬者（ベクター）となるアブラムシやアザミウマ、コナジラミなどの駆除などが防除の中心となります。